《华西医学》是由中华人民共和国教育部主管、四川大学主办的综合性医学学术刊物。其办刊宗旨是：报道医学各专业以及相关学科的科研成果，临床医学各科诊疗经验，医院管理经验，医学教育与继续教育研究与经验，开展国内外学术交流，促进医药卫生事业的发展。
《癫痫杂志》是由教育部主管，四川大学主办，《癫痫杂志》编辑部编辑出版的医学专业类学术期刊。本刊为双月刊，向国内、外公开发行。办刊宗旨是及时、准确、全面地报道国内外癫痫科学领域工作者在防病治病、科学研究、教学等工作中取得的经验、科研成果、技术革新、学术动态等，报道国内外癫痫科学领域的重大研究成果和研究进展。
《生物医学工程学杂志》于1984年3月创刊。本刊由四川省科学技术协会主管，四川大学华西医院、四川省生物医学工程学会主办。本刊作为生物医学工程学综合性学术刊物，主要反映生物工程、医学工程、人工器官、生物材料、生物力学、计算机在生物医学中应用等方面的最新科研成果和科技动态。
《中华眼底病杂志》原名《眼底病》，创刊于1985年9月，至今已出刊27卷。1993年6月改现名以前，由卫生部主管、四川大学华西医院主办。1993年2月转入中华医学会成为中华医学会系列杂志，更名后改由中国科协主管、中华医学会主办，继续委托四川大学华西医院承办。现任总编辑黎晓新教授，现任编辑部主任陆方教授。
《中国呼吸与危重监护杂志》于2001年8月经中华人民共和国科技部、新闻出版署批准，获正式刊号（CN 51-1631/R，ISSN 1671-6205），2002年5月开始正式向国内、外公开发行（邮发代号：62-246）。
《中国普外基础与临床杂志》是由中华人民共和国教育部主管、四川大学华西医院主办的专业性学术期刊。
中国修复重建外科杂志是由中华人民共和国国家卫生健康委员会主管，中国康复医学会、四川大学主办的国家级医学专业学术期刊。于1987年创刊，月刊，每月15日出版。期刊以“修复缺损、重建功能、改善外形，促进结构、功能、形态的完美结合”为办刊宗旨；学科领域覆盖骨科、手外科、显微外科、整形外科、口腔颌面外科、泌尿外科、神经外科、康复医学、再生医学等。期刊自1996年持续被国际权威医学数据库MEDLINE收录，也是国内三大核心期刊数据库（中文核心期刊要目总览、中国科学引文数据库、中国科技核心期刊）来源期刊，是目前能够综合反映我国修复重建外科领域最高发展水平的学术期刊。
《中国胸心血管外科临床杂志》(Chinese Journal of Clinical Thoracic and Cardiovascular Surgery) 于1994年创刊，刊名由原中华人民共和国卫生部部长陈敏章题写。本刊系由教育部主管，四川大学华西医院主办的全国胸部及心脏血管外科专业学术期刊。
2001年6月，中国循证医学/ Cochrane中心在纽约中华医学基金会（CMB）的资助下创办了世界上第一份中文循证医学杂志——《中国循证医学杂志》。《中国循证医学杂志》是由中华人民共和国教育部主管，四川大学主办，中国循证医学中心/ The Chinese Cochrane Center 和四川大学华西医院承办的医学类专业性学术期刊。
